現在的氣相色譜系統中，毛細管色譜柱已被廣泛的應用。在整個毛細管氣相色譜中，柱子的安裝尤為重要，柱子安裝的好壞直接影響到檢測結果。掌握毛細管氣相色譜柱的正確使用的方法，以及在其使用過程中故障處理的方法是非常必要的。
    對于分流進樣，毛細管柱的人口端一定要伸過分流進樣器的分流出口，就是使毛細管柱的人口處于載氣的高流速區域。如果毛細管柱的人口在分流進樣器的分流出口以下，處于載氣的低流速區域，得到的色譜圖就不理想，所以必須將毛細管的人口伸過分流進樣器的分流出口，這樣才會得到尖銳的峰形。
    對于有些有特殊要求的氣相色譜，毛細管氣相色譜柱與進樣器的連接，可以按儀器使用說明書的要求進行安裝。相信隨著毛細管柱分析技術的不斷發展與完善，這一領域的技能會更加趨于成熟。